<?php
/**
 * @title 187. 重复的DNA序列
 * @author start2004
 */

// ini_set("memory_limit", "128M");

// class Solution {
//
//     function find() {
//
//     }
// }

class Solution {

    /**
     * @param String $s
     * @return String[]
     */
    function findRepeatedDnaSequences($s) {
        /**
         * @since 2023-12-01 字符串长度
         */
        $len = strlen($s);
        if($len < 10){
            /**
             * @return
             */
            return [];
        } else {}

        /**
         * @since 2023-12-01 重复的DNA集合
         */
        $repeatedDnaArray = [];

        /**
         * @since 2023-12-01 哈希数组，记录DNA序列的次数
         */
        $hashArray = [];

        /**
         * @since 2023-12-01 2位bit表示核苷酸A,C,G,T
         */
        $nucleotidesArray = [
            "A" => 0,
            "C" => 1,
            "G" => 2,
            "T" => 3,
        ];

        /**
         * @since 2023-12-01 下标0到9，第一个长度10，DNA序列
         */
        $num = 0;
        for($i=0; $i<10; $i++){
            $num = ($num<<2) + $nucleotidesArray[$s[$i]];
        }
        $hashArray[$num] = 1;

        /**
         * @since 2023-12-01 AND操作数字，清掉高位
         */
        $andNum = bindec(str_repeat("1", 18));

        /**
         * @since 2023-12-01 查找是否有重复DNA序列
         */
        for($i=1, $j=10; $j<$len; $i++,$j++){
            $num = (($num & $andNum)<<2) + $nucleotidesArray[$s[$j]];

            /**
             * @since 2023-12-01 判断出现次数
             */
            if(isset($hashArray[$num])){
                $hashArray[$num] += 1;

                /**
                 * @since 2023-12-01 出现第2次记录
                 */
                if($hashArray[$num] == 2){
                    $repeatedDnaArray[] = substr($s, $i, 10);
                } else {}
            } else {
                $hashArray[$num] = 1;
            }
        }

        /**
         * @return
         */
        return $repeatedDnaArray;
    }
}


/**
 * @url http://127.0.0.1/leetcode/202311/2023.11.05_3.php
 */
$datas = [
    ["AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"], // "AAAAACCCCC","CCCCCAAAAA"
];

include_once dirname(__DIR__) . DIRECTORY_SEPARATOR ."xhprof.php";
$xhprof = new Xhprof();
foreach ($datas as $data){
    if(count($data) <= 20){
        var_dump($data);
    } else {
        var_dump(count($data));
    }

    $obj = new Solution();
    $result = $obj->findRepeatedDnaSequences(...$data);
    // $result = $obj->($xhprof->tree($data));
    // $result = $obj->($xhprof->listNode($data));
    // $result = $obj->find(...$data);
    var_dump($result);
    // if(count($result)<=20){
    //     var_dump($result);
    // } else {
    //     var_dump(count($result));
    // }
    echo str_repeat(PHP_EOL, 3);
    echo str_repeat("<br>", 3);
}

// foreach ($datas as $data){
//     $obj = new $data[0][0](...$data[1][0]);
//
//     for ($i=1; $i<count($data[0]); $i++){
//         $func = $data[0][$i];
//         $param = $data[1][$i];
//         $result = $obj->$func(...$param);
//
//         echo $data[0][$i] ."(\"". implode(",", $data[1][$i]) ."\") ";
//             if($result === true){
//                 echo "True";
//             } elseif($result === false) {
//                 echo "False";
//             } elseif($result === null) {
//                 echo "Null";
//             } elseif(is_array($result)) {
//                 var_dump($result);
//             } else {
//                 echo $result;
//             }
//         echo PHP_EOL;
//     }
//
//     echo str_repeat(PHP_EOL, 3);
// }
$xhprof->end();
